Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rin3P59729 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rin3P59729 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rin3P59729 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rin3P59729 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rin3P59729 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rin3P59729 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms