Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd4P58467 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd4P58467 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd4P58467 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms