Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms