Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5eP56382 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5eP56382 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms