Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pex2P55098 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms