Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Faf1P54731 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms