Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms