Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zic1P46684 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms