Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VhlP40338 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VhlP40338 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VhlP40338 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VhlP40338 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms