Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms