Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjc1P28229 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms