Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms