Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms