Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra2P26048 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra2P26048 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra2P26048 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra2P26048 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra2P26048 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms