Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UbtfP25976 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UbtfP25976 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UbtfP25976 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UbtfP25976 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UbtfP25976 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms