Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms