Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifrd1P19182 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms