Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Selenbp1P17563 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Selenbp1P17563 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms