Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OtcP11725 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtcP11725 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtcP11725 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtcP11725 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtcP11725 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtcP11725 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtcP11725 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtcP11725 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtcP11725 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OtcP11725 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtcP11725 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OtcP11725 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtcP11725 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms