Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Khdc1bP0C7A0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Khdc1bP0C7A0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Khdc1bP0C7A0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Khdc1bP0C7A0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc1bP0C7A0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Khdc1bP0C7A0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1bP0C7A0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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