Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Hoxb7P09024 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb7P09024 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb7P09024 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms