Protein–RNA interactions for Protein: P08003

Pdia4, Protein disulfide-isomerase A4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdia4P08003 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdia4P08003 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdia4P08003 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdia4P08003 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdia4P08003 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdia4P08003 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdia4P08003 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdia4P08003 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdia4P08003 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdia4P08003 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms