Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01808 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01808 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01808 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01808 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01808 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01808 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01808 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01808 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01808 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01808 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01808 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01808 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01808 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms