Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms