Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms