Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1bO88384 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms