Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms