Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtogO55225 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtogO55225 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OtogO55225 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OtogO55225 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms