Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms