Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SlkO54988 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SlkO54988 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SlkO54988 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SlkO54988 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SlkO54988 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SlkO54988 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SlkO54988 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SlkO54988 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlkO54988 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms