Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TsksO54887 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TsksO54887 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TsksO54887 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TsksO54887 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TsksO54887 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TsksO54887 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TsksO54887 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TsksO54887 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TsksO54887 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TsksO54887 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TsksO54887 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TsksO54887 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TsksO54887 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TsksO54887 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TsksO54887 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TsksO54887 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TsksO54887 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TsksO54887 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TsksO54887 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms