Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk2a2O54833 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms