Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DffaO54786 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DffaO54786 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DffaO54786 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DffaO54786 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DffaO54786 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DffaO54786 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DffaO54786 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DffaO54786 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DffaO54786 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DffaO54786 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DffaO54786 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DffaO54786 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DffaO54786 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DffaO54786 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DffaO54786 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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