Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FxnO35943 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FxnO35943 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FxnO35943 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FxnO35943 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FxnO35943 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FxnO35943 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FxnO35943 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FxnO35943 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FxnO35943 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FxnO35943 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms