Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad6O35182 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad6O35182 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms