Protein–RNA interactions for Protein: O08934

Uncx, Homeobox protein unc-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UncxO08934 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UncxO08934 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UncxO08934 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UncxO08934 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UncxO08934 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UncxO08934 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UncxO08934 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UncxO08934 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UncxO08934 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UncxO08934 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UncxO08934 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UncxO08934 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UncxO08934 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UncxO08934 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UncxO08934 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UncxO08934 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UncxO08934 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UncxO08934 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UncxO08934 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UncxO08934 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UncxO08934 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UncxO08934 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UncxO08934 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UncxO08934 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms