Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EllO08856 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EllO08856 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EllO08856 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EllO08856 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EllO08856 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EllO08856 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EllO08856 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms