Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dctn1O08788 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms