Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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