Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MsmbO08540 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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