Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20878L7N244 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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