Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms