Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms