Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c3J3QJW5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c3J3QJW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms