Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17lcG5E8I7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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