Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms