Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd5G3UW60 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd5G3UW60 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms