Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm29094F6Q785 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms