Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms