Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam53aE9PV82 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam53aE9PV82 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms